Berlatar di koloni luar angkasa yang damai, perang skala besar antara Federasi Bumi dan Zeon terasa sangat jauh. Namun, rahasia militer yang tersimpan rapat mulai mengancam kehidupan warga sipil. Konflik politik ini justru memicu ketegangan tak terduga di tengah masyarakat.
Seorang bocah bernama Alfred Izuruha mendambakan aksi militer yang seru layaknya dalam film. Kesehariannya berubah total saat ia secara tidak sengaja bertemu dengan sosok pilot Zeon yang menyusup ke koloninya. Pertemuan ini membuka gerbang dunia dewasa yang kelam.
Pilot tersebut adalah Bernard Wiseman, prajurit yang terjepit antara tugas dan realitas pahit. Berusaha menyelesaikan misi rahasia, ia justru menjalin pertemanan unik dengan bocah itu. Persahabatan mereka menciptakan dinamika emosional yang melampaui batas loyalitas.
Hadir pula Christina Mackenzie, tetangga Alfred yang ternyata menyimpan rahasia besar terkait proyek rahasia Federasi. Tanpa disadari, ia dan Bernie berada di pihak berlawanan dalam konflik yang bakal mengubah nasib mereka. Kedekatan mereka menyimpan bahaya besar.
Ketika takdir mulai menuntut pengorbanan, mereka harus menghadapi kenyataan brutal tentang arti sebuah kemenangan. Ketegangan memuncak saat kesalahpahaman mengaburkan segalanya. Di balik mesin perang, sisi manusiawi menjadi taruhan utama dalam tragedi yang menyakitkan ini.
Umat manusia kini berada di ambang kepunahan akibat serangan monster luar angkasa misterius. Dalam upaya mempertahankan eksistensi, mereka mengembangkan teknologi robot raksasa untuk bertempur. Perang antarbintang pun dimulai demi melindungi masa depan bumi.
Noriko Takaya adalah seorang gadis muda yang bermimpi menjadi pilot hebat. Meski kemampuannya sering diragukan, ia terpilih masuk sekolah pelatihan elit. Tekadnya yang membara menjadi harapan terakhir saat situasi di garis depan semakin memanas.
Dia bertemu dengan Kazumi Amano, pilot berbakat yang menjadi sosok panutan sekaligus rival. Mereka harus membangun ikatan kuat di kokpit untuk mengendalikan senjata pemusnah bernama Gunbuster. Kerja sama mereka adalah kunci utama kemenangan besar nantinya.
Di bawah arahan pelatih keras Koichiro Ota, mereka dipaksa menghadapi trauma dan ketakutan mendalam. Pelatihan yang brutal ini menguji batas fisik serta mental mereka demi mempersiapkan diri menghadapi musuh yang jauh lebih kuat dan tak terduga.
Pertarungan ini bukan sekadar tentang kehancuran, namun tentang perjuangan eksistensial melintasi ruang dan waktu. Saat rahasia alam semesta perlahan tersingkap, mereka harus memilih antara keselamatan pribadi atau tanggung jawab sebagai pahlawan umat manusia.