Tahun 2307, cadangan bahan bakar fosil telah habis total di Bumi. Umat manusia kini bergantung pada tenaga surya, namun kesenjangan ekonomi menciptakan konflik antar blok kekuasaan yang tak kunjung usai. Dunia berada di ambang kehancuran akibat perang tanpa henti.
Muncul organisasi misterius bernama Celestial Being yang membawa senjata canggih bernama Gundam. Pilot berbakat Setsuna F. Seiei menjadi garda terdepan untuk melakukan intervensi bersenjata guna menghentikan semua bentuk peperangan di muka bumi ini.
Misi ini melibatkan Lockon Stratos sebagai penembak jitu yang bijaksana, Allelujah Haptism dengan sisi gelapnya, serta Tieria Erde yang sangat kaku. Mereka harus menghadapi tekanan batin saat harus menghancurkan siapa pun yang memicu konflik.
Ketegangan memuncak ketika Graham Aker dari pihak militer menaruh obsesi besar terhadap kekuatan Gundam. Persaingan sengit antara pilot ini menciptakan drama aksi intens yang mempertanyakan apakah perdamaian benar-benar bisa ditegakkan melalui kekerasan.
Setiap pilot terpaksa menghadapi trauma masa lalu di tengah medan pertempuran yang kejam. Mereka berusaha keras mencari jalan keluar dari siklus kebencian abadi, meskipun dunia terus memberikan perlawanan terhadap idealisme mereka yang dianggap sangat berbahaya.
Dunia pasca-apokaliptik bernama Tokyo-3 kini berada di ambang kepunahan total. Makhluk raksasa misterius yang disebut Angel terus menghujani bumi dengan serangan mematikan, memaksa umat manusia berlindung di balik benteng pertahanan terakhir yang berteknologi tinggi.
Seorang remaja penyendiri bernama Shinji Ikari dipanggil secara mendadak ke markas NERV oleh ayahnya yang dingin. Ia diberi beban berat untuk mengemudikan robot raksasa EVA-01 demi menghadapi ancaman Angel yang tak henti-hentinya meneror sisa umat manusia.
Di sana, ia bertemu dengan Rei Ayanami, pilot misterius yang penuh rahasia dan sangat setia pada perintah. Interaksi mereka yang kaku memicu gejolak emosional bagi Shinji yang terus berjuang memahami arti keberadaannya serta alasan mengapa dirinya harus terus bertarung.
Hubungan dengan sang ayah, Gendo Ikari, justru menambah beban psikologis bagi Shinji. Sang komandan operasional, Misato Katsuragi, berusaha menjadi sosok pelindung dan mentor bagi Shinji, namun trauma masa lalu sang bocah tetap menghantui tiap misinya.
Ketegangan memuncak saat serangan musuh semakin brutal, memaksa para pilot untuk menguji batas mental serta fisik mereka. Di balik pertempuran sengit melawan monster, tema kesepian dan pencarian jati diri menjadi inti kisah yang akan mengubah nasib dunia selamanya.