Sebuah misteri kriminal mendebarkan tersaji dalam balutan kisah detektif yang penuh intrik. Segalanya bermula saat kehidupan seorang remaja jenius berubah drastis setelah dipaksa menelan racun misterius oleh sindikat gelap, menjadikannya sosok berwujud anak kecil.
Shinichi Kudo kini harus hidup sebagai bocah bernama Conan Edogawa demi menyembunyikan identitas aslinya. Meski fisiknya mengecil, otak briliannya tetap tajam dalam membongkar berbagai kasus pembunuhan rumit yang kerap membingungkan pihak kepolisian setempat.
Dalam perjalanannya, ia mengandalkan bantuan Ran Mouri, teman masa kecilnya yang setia menunggu. Tak jarang, ia juga harus memanfaatkan Kogoro Mouri, detektif amatir yang kurang kompeten, sebagai perantara untuk memecahkan teka-teki yang ada di hadapannya.
Konflik batin terus menghantui saat ia mencoba menyeimbangkan kehidupan sekolah dengan perburuan organisasi hitam yang merenggut masa remajanya. Kesetiaan dan cinta menjadi motivasi terbesarnya untuk bertahan menghadapi bahaya yang mengintai di setiap sudut kota.
Ketegangan pun memuncak ketika petunjuk demi petunjuk mulai mengarah pada konspirasi besar yang mengancam nyawa orang-orang terdekatnya. Kini, ia harus menggunakan segala kecerdikannya demi mengungkap kebenaran di balik kegelapan yang menyelimuti takdirnya sendiri.
