Tahun 1924, di negara fiktif bernama Sauville, misteri gelap menyelimuti Akademi St. Marguerite yang megah. Di tengah suasana Eropa klasik yang mencekam, teka-teki tak terpecahkan mulai muncul, menuntut logika tajam untuk menyingkap kebenaran yang terkubur.
Kazuya Kujo, seorang siswa pindahan asal Jepang, merasa terasing karena penampilannya yang unik. Nasib membawanya bertemu dengan Victorique de Blois, gadis misterius yang menghabiskan hari-harinya di perpustakaan megah demi memecahkan kasus rumit.
Meski memiliki kepribadian dingin dan sinis, Kazuya Kujo menjadi satu-satunya orang yang mampu memahami sisi tersembunyi sang jenius. Hubungan unik mereka berkembang saat keduanya terjebak dalam berbagai peristiwa kriminal yang memicu bahaya nyata.
Sebagai otak di balik penyelesaian masalah, sang gadis memanfaatkan kecerdasan luar biasa untuk membaca pola dunia. Namun, rahasia kelam masa lalu yang membayangi garis keturunan mereka justru mengancam kedamaian yang coba mereka pertahankan bersama-sama.
Konspirasi politik dan takdir tragis perlahan mulai terungkap seiring berjalannya waktu. Mereka harus menghadapi ancaman yang lebih besar dari sekadar teka-teki biasa, mempertaruhkan segalanya demi menemukan jawaban atas eksistensi mereka di dunia kejam.
