Dunia komedi sekolah yang absurd menanti lewat kehidupan sehari-hari enam siswi unik. Dari masuknya siswi jenius yang masih anak-anak hingga guru olahraga yang eksentrik, keseharian mereka penuh dengan kekacauan lucu yang tak terduga dan sangat menghibur.
Sosok Chiyo Mihama adalah anak ajaib yang duduk di kelas sepuluh. Dia berinteraksi dengan Sakaki, si pendiam yang misterius dan pecinta kucing, serta Ayumu Kasuga, gadis pelupa yang sering melamun dengan cara yang sangat kocak.
Ada pula Tomo Takino yang super energetik dan selalu mencari masalah, didampingi Koyomi Mizuhara yang sering kesal dengan kelakuan temannya. Dinamika mereka menciptakan gesekan komedi yang organik dalam setiap kegiatan sekolah yang membosankan.
Kehadiran Sakaki yang sangat ingin memeluk kucing meski selalu dicakar, beradu dengan obsesi Kagura yang kompetitif dalam bidang olahraga. Persahabatan mereka diuji lewat ujian sekolah, festival budaya, hingga liburan musim panas yang kacau.
Kisah ini menyoroti ikatan persahabatan tulus di tengah masa remaja yang penuh warna. Tanpa konflik berat, penonton diajak menikmati kehangatan hubungan antar karakter yang jenaka, ceroboh, namun sangat dekat di hati dalam menjalani hidup yang santai.
Dunia berada di ambang kehancuran total saat organisasi NERV dikepung oleh pasukan militer yang ingin melenyapkan segalanya. Suasana mencekam menyelimuti markas bawah tanah ini, di mana umat manusia kini harus menghadapi ancaman kepunahan akibat konspirasi besar.
Di tengah kekacauan, Shinji Ikari mengalami kehancuran mental yang parah akibat beban tugas sebagai pilot. Ia merasa terjebak dalam pusaran konflik eksistensial yang membuatnya meragukan arti hidup, harga diri, serta posisinya di dalam dunia yang kian rusak.
Sementara itu, Asuka Langley Soryu berjuang bangkit dari trauma masa lalunya demi mempertahankan harapan terakhir. Hubungan mereka yang penuh ketegangan mencerminkan ketidakmampuan untuk saling memahami, memperdalam luka batin di tengah perang robot raksasa.
Di sisi lain, Rei Ayanami menyimpan misteri yang bakal menentukan nasib seluruh penghuni bumi. Sosoknya yang dingin dan penuh teka-teki menjadi kunci utama bagi rencana yang disusun oleh Gendo Ikari untuk mengubah esensi kemanusiaan selamanya.
Ketegangan memuncak saat batas antara realitas dan mimpi mulai memudar, memaksa para pilot menghadapi ketakutan terdalam mereka. Perjuangan untuk bertahan hidup kini berubah menjadi perjalanan spiritual yang mempertanyakan esensi jiwa serta kesepian manusia.