Dunia futuristik tahun 2029 menjadi tempat di mana teknologi siber sudah menyatu dengan tubuh manusia. Di balik kemajuan megah kota New Port, jaringan kriminal siber mengancam keamanan global. Kehidupan kini menjadi rapuh saat data digital dapat dibajak.
Sosok Motoko Kusanagi, seorang cyborg tangguh yang memimpin unit elit kepolisian bernama Section 9, menjadi benteng terakhir. Ia beroperasi dalam bayang-bayang, memburu peretas misterius yang mampu mengambil alih kendali kesadaran manusia secara paksa.
Batou, rekan setianya dengan mata mekanis, memberikan dukungan fisik yang tak tergoyahkan dalam setiap misi berbahaya. Dinamika mereka mencerminkan perjuangan antara tugas sebagai mesin perang dan sisa-sisa kemanusiaan yang mulai memudar perlahan.
Konflik memuncak saat entitas misterius bernama Puppet Master muncul, mempertanyakan esensi jiwa di dalam cangkang artifisial. Ancaman ini membuat sang komandan mempertanyakan eksistensi dirinya sendiri, apakah ia manusia atau sekadar kumpulan kode data.
Misi ini bukan sekadar pengejaran kriminal biasa, melainkan perenungan mendalam tentang identitas dan kesadaran di dunia digital. Ketika batas antara kenyataan dan simulasi kabur, mereka harus berpacu dengan waktu sebelum seluruh ingatan mereka terhapus.
Dunia berada di ambang kehancuran setelah peristiwa apokaliptik yang dikenal sebagai Second Impact. Kini, umat manusia terancam oleh entitas misterius bernama Angel. Satu-satunya pertahanan yang tersisa adalah robot raksasa Evangelion yang dikendalikan oleh pilot muda terpilih.
Shinji Ikari dipanggil oleh ayahnya yang dingin untuk menjadi pilot Unit-01. Terjebak dalam beban tanggung jawab yang berat, ia harus berjuang menghadapi ketakutan batinnya sambil berusaha menuruti perintah organisasi NERV demi kelangsungan hidup umat manusia.
Di sana, ia bertemu dengan Rei Ayanami, pilot misterius yang tampak tak memiliki emosi, serta Asuka Langley Soryu yang penuh percaya diri namun menyimpan trauma. Hubungan yang kompleks di antara mereka sering kali memicu konflik internal yang sangat emosional.
Misato Katsuragi bertindak sebagai pengasuh sekaligus komandan mereka, berusaha menyeimbangkan profesionalisme tugas dengan kasih sayang. Sementara itu, Gendo Ikari terus mengatur rencana rahasia yang melibatkan masa depan seluruh umat manusia di balik perang.
Pertempuran melawan para Angel bukan sekadar aksi robot, melainkan perjalanan psikologis yang kelam. Saat misteri semakin dalam, mereka dipaksa menghadapi realita yang menyakitkan tentang diri sendiri, kesepian, dan eksistensi manusia di tengah kiamat yang kian mendekat.
