Sebuah kapal luar angkasa misterius jatuh ke bumi, memicu kemajuan teknologi umat manusia yang drastis. Saat kapal raksasa ini diperbaiki sebagai Macross, ancaman alien Zentradi datang menyerang. Kekacauan pun pecah, memaksa ribuan warga sipil mengungsi ke dalam kapal.
Di tengah kekacauan, pilot muda berbakat bernama Hikaru Ichijyo terjebak dalam pertempuran sengit. Ia secara tidak sengaja bertemu dengan gadis cantik nan ceria, Lynn Minmay, yang mengubah arah hidupnya sekaligus menjadi simbol harapan bagi para penyintas.
Ikatan mereka menjadi rumit karena keterlibatan Misa Hayase, seorang perwira tegas yang memikul beban tanggung jawab besar di jembatan kapal. Ketegangan antara tugas militer, cinta segitiga, dan rasa takut akan kehancuran membuat suasana di kapal semakin dramatis.
Roy Focker, mentor sekaligus sosok kakak bagi Hikaru, terus memacu para pilot untuk bertahan hidup. Sementara itu, pasukan Zentradi yang tidak mengenal konsep budaya terus memburu mereka, menganggap kehadiran manusia sebagai ancaman eksistensial bagi seluruh semesta.
Musik dan lagu menjadi senjata tak terduga dalam konflik ruang angkasa yang brutal ini. Akankah melodi mampu meredam amarah para prajurit raksasa, ataukah kemanusiaan akan musnah ditelan oleh kerasnya peperangan yang tak kunjung usai di balik bintang-bintang nan jauh?
