Di masa depan yang kacau, tata surya telah menjadi medan perburuan bagi para pemburu bayaran. Dengan suasana noir futuristik yang kental, kehidupan di luar angkasa penuh dengan bahaya, kemiskinan, dan ambisi yang tersembunyi di balik gemerlap lampu neon kota besar.
Sosok Spike Spiegel yang tenang namun mematikan memimpin kru kapal Bebop. Bersama rekannya Jet Black, seorang mantan polisi yang pragmatis, mereka mencoba bertahan hidup dengan menangkap buronan berbahaya demi imbalan uang yang sangat minim.
Kru ini bertambah aneh dengan kehadiran Faye Valentine, penipu ulung yang licik, serta Ed, peretas jenius yang eksentrik. Mereka menjalin ikatan keluarga yang canggung di tengah kapal yang sering kehabisan bahan bakar dan penuh masalah finansial.
Hubungan mereka sering diwarnai cekcok akibat perbedaan masa lalu yang kelam. Sementara Spike terus dihantui oleh bayang-bayang organisasi kriminal sindikat yang mencarinya, setiap karakter berjuang menghadapi trauma dan penyesalan yang terus membayangi mereka.
Pertarungan sengit di luar angkasa dan konfrontasi dengan musuh dari masa lalu menjadi tantangan tak terelakkan. Mereka mencari arti kebebasan di dunia yang tidak adil, sambil mencoba menerima kenyataan bahwa pelarian dari nasib sendiri sangatlah sulit.
Menjelang Halloween di Mars, sebuah truk tangki meledak dan menyebarkan virus mematikan yang mengancam nyawa jutaan penduduk. Kepanikan melanda kota metropolis ini karena teroris misterius menebar teror. Otoritas pun menjanjikan hadiah fantastis bagi siapa pun yang menangkap pelakunya.
Kesempatan emas ini menarik perhatian Spike Spiegel, seorang pemburu bayaran yang bosan dengan rutinitasnya. Ia tidak bekerja sendirian, melainkan ditemani rekan krunya yang eksentrik dalam misi berbahaya ini. Mereka berharap bisa mendapatkan uang untuk membayar hutang yang menumpuk.
Jet Black, sang kapten yang pragmatis, mencoba menjaga situasi tetap terkendali meski anak buahnya sering bertindak sembrono. Sementara itu, Faye Valentine terus mencari keuntungan pribadi di tengah kekacauan, sering kali berselisih dengan anggota kru lainnya.
Di sisi lain, peretas jenius Ed berusaha melacak jejak digital sang penjahat yang sangat licin. Mereka harus bergerak cepat sebelum musuh melepaskan serangan yang lebih mematikan. Hubungan kru yang penuh ketegangan ini diuji saat mereka menghadapi ancaman nyata yang tak terduga.
Misi ini membawa mereka berhadapan dengan lawan yang memiliki motif kelam dan masa lalu yang tragis. Di antara ledakan dan intrik konspirasi, nilai kemanusiaan dipertanyakan. Akankah kelompok pemburu bayaran ini berhasil mengungkap misteri besar sebelum kota hancur lebur?