Jepang hidup dalam teror konstan akibat serangan monster raksasa yang disebut Kaiju. Pasukan Pertahanan bertugas membasmi ancaman ini, sementara unit pembersihan khusus mengurus sisa-sisa bangkai monster. Di dunia penuh kehancuran ini, aksi penuh adrenalin menanti.
Kafka Hibino sudah lama menyerah pada impian masa kecilnya untuk menjadi prajurit elit. Kini, pria berusia tiga puluh tahun ini hanya bisa memendam kekecewaan saat bekerja sebagai kru pembersih, merasa hidupnya stagnan tanpa arah yang berarti sama sekali.
Pertemuan tak terduga dengan juniornya yang penuh semangat, Reno Ichikawa, memicu api ambisi Kafka kembali menyala. Namun, sebuah insiden aneh mengubah tubuh Kafka menjadi monster berkekuatan dahsyat, menciptakan konflik batin yang sangat rumit dan berbahaya.
Di sisi lain, Kafka harus menjaga rahasia besar ini dari Mina Ashiro, teman masa kecilnya yang kini menjadi komandan hebat. Hubungan mereka yang penuh janji masa lalu kini diuji, karena posisi mereka kini berseberangan di tengah medan perang yang mematikan.
Saat kekuatan misterius itu mulai menguasai dirinya, ia harus menentukan apakah ia akan menjadi pelindung umat manusia atau ancaman yang harus dimusnahkan. Tekad untuk menjaga kedamaian dunia menjadi taruhan terbesar di tengah identitas yang terpecah belah.