Jadi, Hyakkimaru ini punya nasib yang bener-bener nyesek dari lahir. Pas dia lahir, ayahnya malah bikin perjanjian terlarang sama iblis yang bikin dia kehilangan hampir seluruh anggota tubuhnya. Bayi malang ini akhirnya dibuang ke sungai, tapi untungnya ditemukan sama seorang dokter baik hati yang bikin dia tubuh prostetik supaya bisa bertahan hidup dan berpetualang.
Perjalanan hidupnya berubah drastis pas dia ketemu Dororo, bocah pencuri yatim piatu yang nekat. Mereka berdua pun jadi partner perjalanan yang unik banget. Sambil nemenin Dororo, dia terus berburu iblis yang udah 'mencuri' organ tubuhnya. Setiap kali satu iblis tumbang, pelan-pelan dia mulai bisa ngerasain indra manusia kayak pendengaran, penglihatan, sampai rasa sakit yang selama ini nggak pernah dia kenal.
Di balik sikapnya yang kelihatan dingin dan pendiam, Hyakkimaru sebenarnya cuma pengen ngerasain gimana rasanya jadi manusia seutuhnya. Meski harus ngelewatin pertarungan berdarah yang brutal, dia tetep maju terus demi menebus keadilan buat dirinya sendiri. Kisah perjuangannya ini benar-benar nunjukin betapa kuatnya tekad seseorang buat dapetin apa yang emang jadi haknya sejak lahir.
