Dunia berada di ambang kehancuran saat entitas misterius Zonder mulai mengubah manusia menjadi monster pemangsa energi. Ancaman alien yang mengerikan ini mengancam eksistensi bumi, memaksa organisasi pertahanan rahasia GGG bergerak cepat melindungi umat manusia.
Di tengah kekacauan, Guy Shishioh tampil sebagai pahlawan yang terikat dengan teknologi robot canggih. Sebagai pilot utama, ia harus berjuang menghadapi trauma masa lalu sembari memikul tanggung jawab besar untuk menjaga kedamaian seluruh dunia.
Ia bekerja sama dengan Mamoru Amami, seorang anak misterius yang memiliki kekuatan unik untuk menetralkan ancaman Zonder. Hubungan mereka berkembang menjadi ikatan yang kuat, di mana sang pemuda tangguh harus melindungi kepolosan bocah tersebut.
Konflik memuncak saat Mikoto Utsugi sebagai operator setia memberikan dukungan taktis di markas GGG. Tekanan emosional terus meningkat seiring bertambahnya kekuatan musuh, memaksa mereka menguji batasan fisik serta mental demi mempertahankan harapan.
Keberanian menjadi senjata utama dalam pertempuran brutal ini. Dengan semangat membara, mereka bersatu melawan kegelapan yang mengancam realitas. Apakah keberanian mereka cukup untuk menghadapi takdir kejam yang menanti di depan mata dalam laga epik?
Satu tahun pasca perang besar berakhir, kedamaian Bumi dan koloni angkasa mulai terusik oleh ancaman teror baru. Ketegangan politik yang belum reda memicu munculnya kelompok pemberontak misterius yang berniat mengacaukan tatanan dunia demi agenda pribadi mereka.
Lima pilot muda, termasuk Heero Yuy yang dingin, kini harus menghadapi dilema berat tentang masa depan senjata yang mereka kendalikan. Mereka terjebak dalam pusaran konflik moral saat masa lalu para pilot mulai terungkap dengan cara yang sangat tragis.
Duo Maxwell berusaha menahan diri agar tidak kembali berperang, namun situasi memaksa mereka kembali ke kokpit. Di sisi lain, Trowa Barton menghadapi keraguan mendalam akan identitasnya sendiri yang selama ini diselimuti oleh kabut rahasia kelam.
Sementara itu, Quatre Raberba Winner dan Chang Wufei terpaksa memilih jalan yang berbeda untuk menghentikan kehancuran total. Persahabatan mereka diuji saat musuh lama memanfaatkan ingatan masa kecil yang menyakitkan untuk mengguncang keyakinan teguh mereka.
Puncak konspirasi melibatkan sisa-sisa organisasi OZ yang ingin menghapus jejak sejarah melalui serangan destruktif. Pertempuran sengit ini menuntut mereka untuk mendefinisikan arti keadilan sejati serta mengakhiri siklus perang tanpa henti demi harapan generasi mendatang.